Полагают, что название села происходит от фамилии дружинника Жука, который основал укрепления на берегу Десны по приказу Вуйтатича - известного воеводы, служивший еще Владимиру Мономаху и прожил почти 100 лет. На территории Жукина была православная церковь, которая подчинялась митрополиту. Позже было основано поселение женского монастыря, которое занималось различными промыслами, а доходы отдавали в монастырь при Киево-Печерской лавре. Есть документ, датированный 1498 годом, в котором отмечалось, что село принадлежало Роману Есковичу. Первые упоминания о Жукине в исторических источниках относятся к XV веку. Это записи о денежных и медовых налогах ( «дане») в пользу святой Софии: «у Жукини за Виползовскоъ земли 3 кади меду».